致死の呪詛をかけられた妹を人質に取られ、密かに解呪を試みながらも聖戦の総帥を務めるアーノルド・エルガーは、戦いの中で世界の秘密を知る。打開策は、妹の命と引き換えにこの聖戦を勝ち抜くこと。運命に逆らい、呪いを捻じ曲げた先に待ち受ける、究極の選択。総べての始まり、閉幕へと向かう第一部。
生物が歪んで視えるという特殊な視界を持つ高校生・久遠狭霧が、唯一歪まない少女・近衛斎と出会った時、再び開幕の鐘が鳴る──。長い時を経て交錯し融合した魔術と科学。一人の男の手によって神を殺すべく総べての禁忌が犯された今、灰の中から蘇るのは遺物か、異物か。残された謎に迫る第二部、開幕。